使用说明:
1. 在一离心管或PCR管内加入100ng-1μg DNA模板,再加入适量试剂盒提供的Ultrapure Water,至总体积为34μl。
说明:通常100-300ng DNA模板已经足够用于一次标记反应。
2. 加入10μl Random Primer in Buffer (5X),混匀。如有液滴沾在管壁上,高速离心数秒使所有液体集中在管底。
3. 沸水浴加热5分钟,或在PCR仪上100℃加热5分钟(如果不能设置100℃,99℃加热5分钟也完全可以)。
4. 立即放置到预先准备好的冰水浴中至少2-3分钟。
5. 加入5μl Biotin-Labeling Mix。
6. 加入1μl Klenow Fragment,混匀。如有液滴沾在管壁上,高速离心数秒使所有液体集中在管底。
7. 37℃孵育1小时或过夜(不宜超过20小时)。37℃孵育过夜可以显著增加生物素标记DNA的产量,因此推荐孵育过夜(12-20)小时。
8. 加入3μl探针标记终止液,混匀,终止标记反应。至此标记反应已经全部完成,标记好的DNA可以-20℃保存。
9. 此时探针可以直接用于探针标记效率的检测及Southern、Northern等后续操作。
10. 整个探针标记反应的流程参见下表:
100ng-1μgDNA模板 | xμl |
Ultrapure Water | (34-x)μl |
Random Primer in Buffer (5X) | 10μl |
100℃ 5分钟,立即冰浴冷却 | |
Biotin-Labeling Mix | 5μl |
Klenow Fragment | 1μl |
总体积 | 50μl |
37℃孵育过夜 | |
探针标记终止液 | 3μl |
-20℃保存 | |
此时可用于标记效率的检测及Southern、Northern等后续检测 |
11. 探针标记效率的检测:可以对标记好的探针进行适当梯度稀释后,使用碧云天生产的化学发光法生物素标记核酸检测试剂盒(D3308)或其它适当的方法进行检测。通常探针的标记效率可以参考下表:
模板DNA量 | 生物素标记DNA产量 | |
- | 孵育1小时 | 孵育20小时 |
10ng | 80ng | 900ng |
30ng | 150ng | 1350ng |
100ng | 350ng | 1650ng |
300ng | 750ng | 2200ng |
1000ng | 1300ng | 2600ng |
3000ng | 1600ng | 2600ng |
注意:具体的探针标记效率还和模板DNA的长度、纯度等因素有关,上表的数值仅供参考。
12. 使用本试剂盒所获得的生物素标记DNA的长度通常在数百bp左右。具体的长度因模板的长度而有所不同。例如模板DNA的长度为1kb,则生物素标记DNA产物的长度通常为100-1000bp,平均长度约为300bp左右。