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| 产品编号 | 产品名称 | 产品包装 | 产品价格 |
| C2921S | Universal AAV Titration Kit by qPCR | 50次 | 728.00元 |
| C2921M | Universal AAV Titration Kit by qPCR | 200次 | 2328.00元 |
碧云天生产的Universal AAV Titration Kit by qPCR,也称qPCR法通用型AAV滴度检测试剂盒,是一种基于qPCR (Quantitative PCR)方法用于高效、精确和快速测定不同血清型腺相关病毒(Adeno-associated Virus, AAV)滴度的试剂盒。本产品含有优化比例的高品质UDG酶和dUTP,可有效消除PCR扩增过程中带来的产物污染问题造成的假阳性或CT值偏低。
腺相关病毒(Adeno-associated Virus, AAV)是Dependovirus属Parvovirus家族的微小单链DNA病毒,包含100多种血清型。AAV毒感染细胞后通常不会与基因组DNA重组,但可以长期稳定地表达目的基因,特别是可以在很多不分裂的细胞中长期稳定表达。AAV还具有滴度高,体内注射不产生明显的免疫反应,对于增殖和非增殖细胞感染效率高等优点,因此在生物医学领域有非常广泛的应用[1]。
UDG (Uracil-DNA Glycosylase),也称UNG (Uracil-N-glycosylase),可催化含尿嘧啶的DNA链中的尿嘧啶(dU)碱基和脱氧核糖之间的N-糖苷键发生水解,从而释放游离尿嘧啶,主要应用于消除PCR扩增过程中带来的产物污染问题。其防止污染的原理为:在PCR反应中加入适量的dUTP,以dUTP替代dTTP掺入DNA中,形成含dU碱基的PCR扩增产物;后续进行PCR反应时,使用UDG酶选择性切割可能被污染而带入的之前PCR扩增产生的含有dU的单链或双链DNA,从而避免之前的PCR扩增产物可能的污染对于本次PCR扩增带来的负面影响。
本试剂盒适用范围广。本试剂盒是以目的基因载体质粒中AAV2的ITRs(反向末端重复序列)作为目的基因进行扩增定量,适用于各种血清型(serotype) AAV的滴度测定。AAV的血清型取决于其衣壳蛋白的结构,也就是由包装AAV时使用的Cap基因的类型决定。通过改造AAV2 (将含有目的基因及AAV2 ITRs的载体质粒、含有目的血清型的Cap基因和AAV2 Rep基因的质粒、腺病毒辅助质粒三质粒一起转染293细胞),即可获得不同血清型的重组AVV。因此,只要包装AAV时使用的目的基因载体质粒中的ITRs来源于AAV2,无论是哪一种血清型,都可以使用本试剂盒进行滴度测定。
本试剂盒可以精确定量。本试剂盒提供了DNase I,可以充分去除AAV包装质粒污染,并通过qPCR精确测定AAV的拷贝数,以确保后续AAV的用量准确。同时本试剂盒中含有UDG酶和dUTP,可以有效避免PCR扩增产物污染而导致的定量不准确。
本试剂盒操作快速简便。获得AAV病毒后,按照本试剂盒操作流程,先使用核酸酶去除游离核酸,再使用裂解液使蛋白质变性,即可用于滴度测定。整个操作步骤仅需约2小时即可实现AAV滴度的准确定量。
本试剂盒提供qPCR实验所需的预混液BeyoFast™ SYBR Green qPCR Mix (防污染型)和特异性引物,预混液包含了BeyoFast™ Taq DNA Polymerase、UDG酶、PCR Buffer、dNTPs、dUTP、SYBR Green I荧光染料、稳定剂和镁离子等所有的通用组分,引物以AAV2 ITR基因序列作为靶点所设计,二者结合可用于AAV DNA的超高灵敏度定量检测。此外,本试剂盒提供Positive Control,即阳性对照,用于检测试剂盒本身是否能正常工作以及作为标准品制作标准曲线。
本试剂盒用于标准曲线检测的平均Ct值见下表,扩增曲线参考图1,拟合的标准曲线参考图2。
| Target | 109 copies | 108 copies | 107 copies | 106 copies | 105 copies | 104 copies | NTC |
| 平均Ct值 | 11.50 | 15.03 | 18.81 | 23.33 | 27.65 | 31.09 | 36.05 |
图1.碧云天Universal AAV Titration Kit by qPCR (C2921)用于标准品的扩增曲线图。将本试剂盒中的Positive Control进行梯度稀释,即每个反应中的质粒量分别为108 copies、107 copies、106 copies、105 copies和104 copies,然后用本试剂盒进行qPCR检测。使用Ultrapure Water作为阴性对照;NTC, negative control。实测数据可能会因样品、检测仪器等的不同而存在差异,图中数据仅供参考。
图2.碧云天Universal AAV Titration Kit by qPCR (C2921)检测后拟合的标准曲线图。将本试剂盒中的Positive Control进行梯度稀释,即每个反应中的质粒量分别为109 copies、108 copies、107 copies、106 copies、105 copies和104 copies,然后用本试剂盒进行qPCR检测。使用Ultrapure Water作为阴性对照。实测数据可能会因样品、检测仪器等的不同而存在差异,图中数据仅供参考。
本试剂盒提供Low ROX和High ROX,广泛兼容于无需ROX和需要Low ROX或High ROX作为校正染料的荧光定量PCR仪。ROX的作用是用于校正与PCR无关的荧光波动,从而最大限度减少孔间差异。这种差异可能由多种因素引起,如移液误差及样品蒸发等。不同的荧光定量PCR仪对ROX的要求不同,请根据实际所用仪器在配制反应体系时选择高浓度ROX (High ROX)、低浓度ROX (Low ROX)或不加ROX。常用仪器所需ROX类型请参考如下表格。
| 添加ROX类型 | 适用PCR仪 |
| 不需添加 | Bio-Rad: CFX384, CFX96, MiniOpticon, iCycler IQ, MyiQ and iQ5; Eppendorf: Mastercycler ep realplex and realplex2 s; Qiagen/Corbett Rotor-Gene: 6000; Roche LightCycler 480; Cepheid SmartCycler; Illumina Eco qPCR |
| Low ROX | ABI: 7500(Fast), ViiA 7, QuantStudio 6 and 7 Flex Systems; Stratagene: Mx3000P, Mx3005P and Mx4000; Qiagen/Corbett Rotor-Gene: 3000; Bio-Rad/MJ: Chromo4, Opticon 2 and Opticon |
| High ROX | ABI GeneAmp 5700; ABI PRISM 7000, 7700; ABI 7300, 7900HT(Fast); ABI StepOne (Plus) |
本试剂盒如果用于常规的96孔板qPCR检测(建议反应体系为20µl)或384孔板qPCR检测(建议反应体系为10µl),本产品小包装分别可以进行50次和100次检测,中包装分别可进行200次和400次检测。
包装清单:| 产品编号 | 产品名称 | 包装 |
| C2921S-1 | DNase I (1U/μl) | 100μl |
| C2921S-2 | Reaction Buffer (10X) | 120μl |
| C2921S-3 | DNA Extraction Solution | 2.5ml |
| C2921S-4 | Enzyme Mix | 100μl |
| C2921S-5 | Stop Solution | 2.5ml |
| C2921S-6 | BeyoFast™ SYBR Green qPCR Mix (2X, with UDG) | 500μl |
| C2921S-7 | AAV Primer Mix (10μM) | 50μl |
| C2921S-8 | Positive Control | 50μl |
| C2921S-9 | Low ROX (50X) | 20μl |
| C2921S-10 | High ROX (50X) | 20μl |
| C2921S-11 | Ultrapure Water | 2ml |
| — | 说明书 | 1份 |
| 产品编号 | 产品名称 | 包装 |
| C2921M-1 | DNase I (1U/μl) | 400μl |
| C2921M-2 | Reaction Buffer (10X) | 480μl |
| C2921M-3 | DNA Extraction Solution | 10ml |
| C2921M-4 | Enzyme Mix | 400μl |
| C2921M-5 | Stop Solution | 10ml |
| C2921M-6 | BeyoFast™ SYBR Green qPCR Mix (2X, with UDG) | 2ml |
| C2921M-7 | AAV Primer Mix (10μM) | 200μl |
| C2921M-8 | Positive Control | 200μl |
| C2921M-9 | Low ROX (50X) | 80μl |
| C2921M-10 | High ROX (50X) | 80μl |
| C2921M-11 | Ultrapure Water | 8ml |
| — | 说明书 | 1份 |
-20ºC保存,一年有效。BeyoFast™ SYBR Green qPCR Mix (2X, with UDG)、Low ROX (50X)、High ROX (50X)须-20ºC避光保存,并尽量避免反复冻融。
注意事项:推荐按照使用说明进行DNase I的消化,否则会因为AAV包装质粒的干扰,导致检测出来的AAV滴度偏高。
使用前需确保试剂完全融化,上下颠倒轻轻混匀后使用。混匀过程中尽量避免产生气泡。
BeyoFast™ SYBR Green qPCR Mix (2X, with UDG)、Low ROX (50X)、High ROX (50X)中含有荧光染料,保存本产品或设置PCR反应时应避免强光照射,以尽量避免荧光淬灭问题。
经测试,本产品反复冻融10次对使用效果无显著影响,但仍需尽量避免反复冻融。反复冻融可能使产品性能下降。
qPCR检测是超高灵敏度的检测,请尽量在标准的PCR实验室中进行检测。PCR反应设置区域须尽量避免各种可能的扩增产物的污染。虽然本产品为防污染性,但仍建议勿在PCR反应设置区域撕开PCR封板膜或打开PCR管盖,PCR产物宜密封后按扩增后产物要求处理,以避免超高浓度的PCR产物污染实验环境。
建议使用带滤芯的吸头配制PCR体系,这样可以最大限度的避免污染导致的滴度虚高问题。推荐BeyoGold™无菌滤芯盒装吸头(FTIP631/FTIP635/FTIP638)。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
| Reagent | Volume |
| AAV | 2µl |
| Reaction Buffer (10X) | 2µl |
| Ultrapure Water | 14µl |
| DNase I, RNase-free (1U/μl) | 2µl |
| Total Volume | 20µl |
| Reagent | 1 Sample | 10 Samples |
| DNA Extraction Solution | 45.5µl | 455μl |
| Enzyme Mix | 2µl | 20μl |
| Digestion Solution | 47.5µl | 475µl |
| Tube Number | Dilution Methods | Concentration |
| ST0 | 5μl Positive Control (2×109 copies/μl)+45μl Ultrapure Water | 2×108 copies/μl |
| ST1 | 5μl ST0+45μl Ultrapure Water | 2×107 copies/μl |
| ST2 | 5μl ST1+45μl Ultrapure Water | 2×106 copies/μl |
| ST3 | 5μl ST2+45μl Ultrapure Water | 2×105 copies/μl |
| ST4 | 5μl ST3+45μl Ultrapure Water | 2×104 copies/μl |
| ST5 | 5μl ST4+45μl Ultrapure Water | 2×103 copies/μl |
| Reagent | Volume |
| BeyoFast™ SYBR Green qPCR Mix (2X, with UDG) | 10μl |
| AAV Primer Mix (10μM) | 1μl |
| Template | 5μl |
| Without or with Low/High ROX (50X) | 0 or 0.4μl |
| Ultrapure Water | To 20μl |
| 产品编号 | 产品名称 | 包装 |
| C2901 | 通用型病毒浓缩试剂盒 | 可用于150ml/600ml/3L |
| C2921 | Universal AAV Titration Kit by qPCR | 50次/200次 |
| C2923 | Adenovirus Titration Kit by qPCR | 50次/200次 |
| C2925 | Lentivirus Titration Kit by qPCR | 50次/200次 |
| FSF002 | 荧光定量PCR用封板膜(ABI分装) | 20片/包装 |
| FSF035 | BeyoGold™荧光定量PCR用封板膜(压敏型) | 20片/100片 |
| FSF039 | BeyoGold™荧光定量PCR用封板膜(压敏型, 进口分装) | 20片/100片 |
| FTUB325 | BeyoGold™ qPCR八联排管(0.2ml, 平盖, 透明) | 125排/1250排 |
| FTUB326 | BeyoGold™ qPCR八联排管(0.2ml, 平盖, 透明, 6条/袋) | 50袋/250袋 |
| FTUB333 | 荧光定量PCR用96孔板(ABI原装) | 20个/包装 |
| FTUB384 | 荧光定量PCR用384孔板(ABI分装) | 20个/包装 |
| FTUB335 | BeyoGold™荧光定量PCR用96孔板(0.2ml, 无裙边, 透明) | 1盒/5盒 |
| FTUB337 | BeyoGold™荧光定量PCR用96孔板(0.2ml, 半裙边, 透明) | 1盒/5盒 |
| FTUB339 | BeyoGold™荧光定量PCR用96孔板(0.2ml, 高裙边, 磨砂) | 1盒/5盒 |
| R0127 | RNase, DNase, RNA and DNA Away | 250ml |
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